10 миллионов долларов на здоровье одного человека

10 миллионов долларов. Именно такой приз может получить любая компания за самое быстрое и точное секвенирование (установление последовательности пар оснований) генома человека. Логика соревнования понятна: если находятся люди, способные заплатить около 10 миллионов долларов за полет в космос, то наверняка они же заплатят за полное исследование своих генов. Крэг Вентер (J. Craig Venter), один из "отцов" проекта "Геном человека", сообщил в интервью о целях, преследуемых спонсорами приза. По его словам, приз в 10 миллионов долларов будет способствовать скорейшему развитию персонализированной системы медицины, а также повысит интерес компаний к исследованию скоростных методов секвенирования.
Для сравнения, стоимость определения 1 пары оснований составляла 10 долларов в 1990 году, а на текущий момент составляет 0.1 цента. Размер человеческого генома составляет около 6 миллиардов пар оснований. Возникает вопрос: как такая новость затрагивает компьютерную тематику? Ответ заключается в скорости расшифровки последовательностей пар оснований, которая напрямую зависит от быстродействия вспомогательных компьютерных систем. Действительно, большая часть затрат связана с обсчетом результатов для исключения их неоднозначной трактовки и формировалась в течение 16 лет в основном из стоимости компьютерного оборудования. Появление высокопроизводительных компьютеров все больше и больше удешевляет стоимость установления точной последовательности оснований в геноме.

Для выполнения поставленной задачи - полного установления последовательности пар оснований за один день - каждая из соревнующихся компаний должна иметь компьютерные мощности, сопоставимые с мощностью суперкомпьютера №1 Blue Gene, а это более 100 терафлопов. Логично предположить, что это несопоставимо с текущими возможностями мелких компаний, однако дальнейшее развитие компьютерных систем позволит включиться в соревнование даже одиночным лабораториям. Любопытно, что The X Prize Foundation предлагает надбавки и премии за секвенирование геномов известных людей, которые входят в список, составленный самой компанией. Упоминания о Билле Гейтсе в данном списке не встретилось.